«Невская мануфактура» уже горела 12 апреля 2021 года. Тогда у здания-памятника обрушились межэтажные перекрытия и кровля, а также частично разрушился фасад западного корпуса. Во время пожара погиб один из спасателей, еще двое получили тяжёлые ожоги.
В мае 2021-го было возбуждено уголовное дело по части 2 статьи 238 УК РФ (совершение преступления группой лиц по предварительному сговору). Гендиректора «Невской мануфактуры» Максима Макеева и его заместителя Алексея Михневича обвиняли в оказании услуг, не отвечающих требованиям безопасности, а также в нарушении требований по сохранению объектов культурного наследия.
В сентябре 2023 года дело прекратили с мотивировкой об истечении сроков давности.
В 2022-м стало известно, что на территории «Невской мануфактуры» планируют построить жилой квартал. В ноябре того же года стартовали противоаварийные работы.