По предварительным данным, с помощью этой разработки уже удалось восстановить последовательности геномов ранее неизвестных коронавирусов.
В лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ разработали сборщик для расшифровки геномов коронавирусом, получивший название coronaSPAdes.
Сборщик SPAdes позволяет производить расшифровку геномов живых организмов, в том числе вирусов. Пока ученые не могут читать геномы как книгу: от начала и до конца. В работе им приходится исследовать отдельные фрагменты, которые потом складываются в своего рода пазл, состоящий из миллиона частей. Сборщик помогает решить эту алгоритмическую задачу.
Уже сейчас разработка ученых СПбГУ позволяет восстанавливать геномы коронавирусов de novo, гораздо эффективнее и качественнее, чем альтернативные подходы.
В лаборатории сейчас занимаются усовершенствованием SPAdes, при этом ученые начали уже активно использовать сборщик при работе.
